两者有关联，不过也有明显的区别。在《史记·太史公自序》里有过大致的比较。
首先，道家借鉴了阴阳家的理论
阴阳家对中国古代思想最重要的贡献，就是提出“四时、八位、十二度、二十四节各有教令”：
四时——春夏秋冬；
八位——八卦之位，即乾、坎、艮、震、巽、离、坤、兑；
十二度——古代为观测日、月、五星的位置和运动，把黄赤道带自西向东划分为十二个部分，称为十二度，也称十二次；
二十四节，即二十四节气，这个大家都熟悉。
阴阳家思想的正式出现，晚于道家，其借鉴了《老子》等道家著作的思想，但在此基础上形成了更加完善、系统的理论，反过来又被战国时的道家采纳：
道家......其为术也，因阴阳之大顺，采儒墨之善，撮名法之要...
可以这么理解：道家是集各家之所长，以阴阳家的理论为基础，还广泛汲取了儒、墨、名、法等各派的精髓。
因此道家与阴阳家还是有很大区别的，其中最明显的一点，就是对待自然规律的态度。
阴阳家主张“畏惧”，道家追求“顺势而为”
“阴阳之术，大祥而众忌讳，使人拘而多所畏”。
阴阳家认为，四时、八位、十二度和二十四节气都有一系列颜严肃的规则，什么时候适合干什么、忌讳做何事，都有很严格的规定，顺之者昌、逆之者亡，因此在古人看来，阴阳家“使人受束缚而多所畏惧”，过于强调对规律的顺从，实际上是对人的束缚。
而道家则积极得多：
“使人精神专一，动合无形，赡足万物”，道家使人精神专一，行动合乎无形之“道”，使万物丰足。
“与时迁移，应物变化，立俗施事，无所不宜，指约而易操，事少而功多。”随着时势的发展而发展，顺应事物的变化，树立良好风俗，应用于人事，无不适宜，意旨简约扼要而容易掌握，用力少而功效多。
一言一概之：阴阳家过于强调对自然规律的顺从，是纯粹的“无为”；而道家既主张“无为”，也主张有为，用“道”来探究自然、社会、人生之间的关系，具有辩证法因素和无神论倾向。
提起阴阳二字，扑面而来的是一种神秘。因为提起阴阳，大家自然而然地想到了鬼神之说，而鬼神一向是社会上最有争议的。相信鬼神存在的人，拿不出存在的证据，相信不存在的，同样拿不出不存在的证据。
阴阳
而阴阳家确实很容易联想到这一点，事实上阴阳家和道家有密切的关系，因为阴阳家根本是从道家中细分出来的。道家研究的东西很多，而阴阳家则专门围绕道家中“阴阳”和“五行”发展自己的学说。比如阴阳家对宇宙的理解，就是根据《周易》中的阴阳观念进行阐述；而且大家耳熟能详的九州理论，也是阴阳家根据《尚书》中的九州概念进行发展的。阴阳家认为世界分为大九州，中国是大九州之中的赤县神州，而中国内部又可细分为小九州，阴阳家的九州理论流传甚广，广泛应用于玄幻小说和仙侠小说中。
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